3.évad:Gretchen Morgan a CÉG egyik alkalmazottja. Az évad első részében tűnik fel először, amikor egy panamai bárban megfenyegeti Lincoln-t: Náluk van LJ és Sara, akiket elraboltak, annak érdekében, hogy ezzel zsarolják Lincoln-t és Michael-t. Amennyiben Michael nem szökteti meg a Sonából, 1 héten belül, a vele együtt raboskodó James Whistler-t, megölik LJ-t és Sara-t. Gretchen és Lincoln naponta találkoznak egy panamai bárban, hogy megbeszéljék az aznapi teendőket. Gretchen a Susan B. Anthony álnevet használja Lincoln előtt. Később Lincoln Whistler barátnője után nyomoz, majd elvesz tőle egy madaras könyvet, de Gretchen rájön, ezért miután megfenyegeti Lincoln-t, visszaveszi a könyvet és bejuttatja Whistler-nek a Sonába. Michael csak akkor kezd szöktetésbe, ha beszélhet telefonon Sara-val, ezért Gretchen végül engedélyezi a beszélgetést, ám ez csak egy trükk, mely során Lincoln megtudja Sara tartózkodási helyét és megkísérli kiszabadítani. Miután ez kudarcba fullad, Gretchen megöli Sara-t. Levágja a fejét, majd egy dobozban elküldi Lincoln-nak. Ezzel akarja meggyőzni, hogy minden próbálkozásuk felesleges és LJ-vel is megteszi, ha szükséges. Később, Gretchen megöli a Sona sírásóját, miután az át akarja verni. Kiderül, hogy Gretchen-t korábban többször tartották fogságban és sokszor megerőszakolták, talán ez okozta a változást, amitől ilyen tettekre lett képes. Miután Lincoln megpróbálja átverni Gretchen-t, a nő kishíján megöli LJ-t. Lincoln LJ szöktetését is megkísérli, de Geretchen ezt is megakadályozza. Kiderül, hogy Gretchen a Tábornoktól kapja az utasításokat. Meg kell ölnie Michael-t és Lincoln-t, Whistler-t pedig egy "tisztítótűz" hadművelettel kell kihoznia, miután Michael még mindíg nemtudta kihozni. Gretchen parancsba adja Whistler-nek, hogy ölje meg Michael-t, néhány emberét pedig ráküldi Lincoln-ékra. Gretchen vezetésével, a CÉG helikoptereket küld a Sonába, de nem sikerül kihozniuk Whistler-t. Később a Sona tábornoka megtudja, hogy Gretchen intézte a helikoptereket és hogy fogva tart egy 16 éves fiút. Miután megkínozza Gretchen-t, az elárulja a fiú tartózkodási helyét, de a nő így akarja csapdába csalni a tábornokot, akit sikerül megölnie kísérőivel együtt, majd elszökik a helyszínről. Gretchen Sucre-t is megzsarolja Maricruz életével, hogy szerezzen információkat Lincoln-ról. Sucre és Lincoln egy bombát rejtenek el a nő kocsijában, de ezt is kiszúrja. Gretchen kezdi úgy érezni, hogy Lincoln-ék át akarják verni, ezért elrabolja Sofiát is. Később kiderül, azért van szüksége Whistlerre, mert fontos koordináták vannak birtokában. Miután Michael sikeresen megszökteti Whistler-t, Gretchen egy nyomkövető segítségével rátalál a szökevényekre és megkísérli kihozni Whistler-t. Ez nem sikerül, végül egy panamai múzeumban találkozik újra Michael-el, Lincoln-al és Whistler-rel, hogy Whistler-t elcserélje LJ-re és Sofiára. Itt derül ki, nem a koordináták miatt akarták, hogy Whistler kint legyen a börtönből, hanem valami másért. A csere lezajlása után Gretchen és emberei megpróbálják megöli Michaelt, LJ-t és Lincolnt, ám biztonsági őrök zavarják meg őket. Sofia rájön, hogy Whistler nem az, akinek mondja magát, ezért otthagyja a férfit. Whistler és Gretchen elmenekül a helyszínről. Az évad végén Gretchen, Whistler és Mahone hajtanak el egy kocsival, aki újra csatlakozni akar a CÉG-hez.

4.évad:Egy hónappal később, Gretchen, Whistler és Mahone egy fogadásra mennek, Los Angeles-be, ahová Michael követi őket. Egy elektronikus kártyát kell megszerezniük, de Michael rájuk talál, majd pisztolyt fog Gretchen-re. Kishíján megöli, de a nő elárulja, hogy nem ölte meg Sara-t. A dobozban csak egy Sara-éhoz hasonló fejet küldött el Lincoln-nak, mivel Sara már korábban elszökött. Tudta, ha Lincoln és Michael tudomására jut Sara szökése, már nem biztos, hogy végrehajtották volna a szöktetést. Michael végül elengedi Gretchen-t és Whistler-t. Később kiderül, hogy Whistler mindvégig a CÉG ellen dolgozott és Gretchen csak egy hamis kártyát szerzett meg a Tábornoknak, az eredeti Whistler-nél van. A Tábornok azt hiszi, hogy Gretchen összedolgozott Whistler-rel a CÉG ellen, ezért ráküldi a bérgyilkosát, Wyatt-et, aki nem öli meg, azonban fogságba ejti. Gretchen napokig szenved egy sötét, büdös lyukba zárva, minimális ételt és italt kapva. Végül sikerül megszöknie, miután megöli az őrt, aki az ebédet hozta neki. Első útja a riverside-i otthonába vezet, ahol találkozik húgával és kislányával, aki a húgát hiszi anyjának. Gretchen rendbeteszi magát a fogság megrázkódtatásaitól, majd pénzt és fegyvert vesz magához, hogy bosszút álljon a CÉG-en. Megszerzi Whistler hamis iratait, amelyek segítségével eljut egy korábban kibérelt lakásába, ahol T-Bag-el találkozik. Megkötözi a férfit, végül azonban mégis szövetségre lépnek egymással, mivel T-Bag vette fel Whistler álnevét, Cole Pfeiffer-t, akinek segítségével eljuthatnak a "Scylla"-hoz, ami megbuktathatja a CÉG-et, valamint nála van a madaras könyv is. T-Bag Gretchen utasításait követve, elfogja Michael-t, Bellick-et és egy titkárnőt, majd arra kényszeríti Michael-t, hogy megfejtse Whistler madaras könyvének a titkát. Michael rájön, hogy a könyvben a lapok egy tervrajzzá állnak össze, ami elvezetheti őket a Scyllához. Gretchen leleplezi magát Michael előtt és egy alku keretében, ő is be akar szállni a Scylla utáni vadászatba. Kénytelenek Gretchen-t és T-Bag-et is bevenni a csapatba. Gretchen alkut köt egy ázsiai cégvezetővel, aki nem mellesleg egy hidegvérű gyilkos, hogy megszerzi neki a Scyllát, 125 millió dollárért. Ebből 25 millió lenne T-Bag része. Gretchen találkozót beszél meg Sara-val, hogy tisztázzák a történteket. Kiderül, hogy amíg Sara fogságban volt, Gretchen egy korbáccsal verte, valamint, hogy egy Michelle Taylor nevű őrt is megölt, mert segített megszökni Sara-nak. Gretchen odaadja a korbácsot Sara-nak, hogy visszaadja neki az ellene elkövetett sérelmeket, de Sara végül nem teszi meg, csupán ennyit mond: "...mikor ennek vége, fizetni fog Michell-ért!"