A cég (The company) egy titkos csoportja multinacionális cégeknek, és csak azok tudnak róla akik nekik dolgoznak. Befolyása, és ereje akkora, hogy a Fehér Házba is kiterjed befolyásuk, és irányítják minden döntését az országnak. Fő célja, hogy átvegye az irányítást az ország gazdasága fölött. Caroline Reynolds-al a volt amerikai alelnöknővel együtt, A cég tartja irányítása alatt, a villanyszámlák mértékét, majd később, az ország gazdaságát is. A cég előzékeny minden olyan személlyel szemben aki nekik dolgozik, és bizotítékot is kér, hogy elérjék céljaikat.

Minden erejüket latba kell vetniük, hogy megszerezzék az ország gazdasági irányítását, előfordul, hogy illegális módszereket is bevetnek, Caroline Reynolds testvérének a cégén, az Ecofield-en keresztül. ha egy dolgozójuk kiszivárogtat valami információt az Ecofield-ről a nyilvánosságnak, A cég hihetetlen messzeségig elmegy, csakhogy elkapja. Ez az ember Aldo Burrows volt. Azon célból, hogy a nyilvánosság elől eltitkolják, A cég kitervelt egy összeesküvést, és Caroline Reynolds alelnök erejével, elítélték a fiát, Lincoln Burrows-t, Terrence Steadman meggyilkolásáért, így a vád csak kitaláció, az ártatlan Lincoln ellen.

A cég egyre jobban agódott Caroline Reynolds esélyei miatt, hogy megválasszák az elnöki posztra, miután az ő támogatása kedett zuhanni, és szavazatai is csökkentek. Miután caroline elvesztette Richard Mills támogatását, az ő energiaprogramjában, A cég úgy döntött, hogy ki kell szálnia a versenyből önként, vagy általuk. Rendkívülmeglepődtek, amikor Caroline nemsokra rá megölette az elnököt (ez egy sajnálatos szívroham volt), és azután felesküdött az Amerikai Egyesült Államok új elnökének.

A szövetség Caroline és A cég között, kétes volt ezután. első pillantásra úgy tűnt, hogy kimért maradt velük szemben. Sokkal nehezebb letta dolguk hogy elkövessenek valami cselszövést ellene, mert sokkal erősebb pozícióban volt, amióta megválasztották elnöknek. Ha még mindig kapcsolatban állnak, akkor nem világos továbbra ki irányít kit.

A cég néhány ügynöke:

Samantha Brinker, alakítja Michelle Forbes, magas beosztott ügynök, aki A cég, és Caroline Reynolds alelnök között közvetít.

Jane Phillips, alakítja Kristin Lehman, egy volt ügynök aki kilép A cégtől, és csatlakozik Aldo Burrows-hoz, abban a reményben, hogy sikerül legyőzniük A céget.

Aldo Burrows, alakítja Anthony Denison, Lincoln Burrows, és Michael Scofield apja, a sorozat egyik főszereplője. Kilépett A cégtől, és azóta azon van hogy elég bizonyítékot szerezzen hogy megsemmisíthesse A céget. Később megöli Alexander Mahone különleges FBI ügynök, aki a céggel együtt dolgozik.

William Kim aka. Bill Kim, alakítja Reggie Lee, ő A cég egyik titkosügynöke, közvetlen főnöke Pad Man néven ismert.

Quinn, alakítja Michael Gaston, A cég egyik brutális ügynöke, akit Kellerman, és Dany Hale sikertelenségei után L. J. Burrows, Veronica Donovan, és Nick Savrinn kiiktatásával bíznak meg. Későb LJ egy gödörbe löki, és később Kellerman és Dany Hale magára hagyja meghalni.

Tangrin, alakítja Jacqueline Williams, aki magát riportenek adja ki, Sue Parsons néven, azzal a céllal hogy megfenyegesse Lincoln Burrows-t, hogy hagyja abba a fia életének kockáztatását, azzal hogy követi az igazságot a gyilkossági ügyével kapcsolatban.

Ügynökök álnevekkel:

"Agent Blondie", alakítja Steven Chester Prince, egy ügynök aki Bill Kim-nek dolgozik, és az a feladata hogy megvédje Terrence Steadman-t, tartózkodási helyén. Később ő öli meg Veronica Donovan-t, és az ő feladata hogy megrendezze Sara Tancredi öngyilkosságát. miután megrendezi Alexander Mahone fiának balesetét, Mahone megöli.

"Pad Man", alakítja Leon Russom, egy magas beosztásban dolgozó ügynök, ő Bill Kim ügynöke. Ezidáig nem sokat beszélt, csak rövid tömör utasításokkal látta el Bill Kim-et.