Vigyázat!! Spoiler!!!

Metru Nui nagy veszélyben van. Ezért Lhikan Toa átadja erejét hat matoránnak. A hat matoránból, hat új Toa lesz. Vakama, Nokama, Matau, Nuju, Onewa és Whenua. Képességeiket rögtön próbára is teszi első küldetésük.

A Morbuzakh nevezetű növény, egész Metru Nuit benövi indáival, veszélyeztetve a matoránok biztonságát. A hat Toának meg kell találnia a hat legerősebb Kanoka Korongot minden Metruban. Csak ezek együttes ereje képes elpusztítani a Morbuzakh főgyökerét. Minden Metruban lakik egy matorán, aki tudja hol található a Korong. A Toák megmentik a hat matoránt és sikeresen megszerzik a Korongokat. A Morbuzakh főgyökerét Ta-Metruban találják meg. És a korongok erejével sikerül elpusztítaniuk a főgyökeret.

A Toák győztesen jelentek meg a Colosseumban Dume Turaga előtt. Bizonyítékul elviszik neki a hat Kanoka Korongot. Dume azonban kineveti őket és egy lehetetlen próba elé állítja a még fiatal Toákat. Át kell jutniuk a protodermisz-tenger túlpartjára, miközben a pálya mechanizmusa teljes kapacitással működik. A Toák elbuknak a próbán, ezért Dume "csalóknak" kiáltja ki őket és megparancsolja a bebörtönzésüket. Vakama, Nokama és Matau megmenekülnek, de Nuju, Onewa és Whenua fogságba esnek.

Vakama, Nokama és Matau a protodermisz-csöveken át menekülnek, miközben a Sötét Vadászok, Nidhiki és Krekka üldözik őket. A három Toa úgy dönt, megpróbálják kiszabadítani Lhikan Toát, a Sötét Vadászok fogságából. Vakama felfedezi, hogy a nagy Kanoka Korongok összeolvaszthatók, de még fogalma sincs, hogy mire valók így együtt.

Eközben a börtönben Onewa, Nuju és Whenua megismerkednek egy titokzatos Turagával, aki elkezdi tanítani őket.

Po-Metruba érkezve, Vakamáék a várost üresen találják. A Sötét Vadászok itt ütnek rajtuk, de egy kikanolon-csorda felbukkanása, megfordítja a csata kimenetelét. Nidhiki és Krekka visszavonulnak.

Nokama felfedezi maszkja erejét, így képes szót érteni a kikanolon csorda vezérével. A rahik segítségével kelnek át Po-Metru sivatagán és jutnak el a Végtelen Suttogás völgyébe. A vahki osztagokat kicselezve, bejutnak a börtönbe. Matau felfedezi maszkja erejét, így a Sötét Vadászokat is sikerül lerázniuk.

A börtönben raboskodó Toák felismerik maszkjaik erejét a Turaga segítségével és így kijutnak a cellából. Az épület folyosóin haladva, a Toák újra egyesülnek társaikkal. A Turaga ekkor felfedi magát. Kiderül, hogy ő Lhikan. Miután átadta az erejét, Turagává változott. Egy félretett matorán-tartályban a Metru Toák megtalálják Dume Turagát. Ezek után már egyértelmű, hogy a várost nem az igazi Dume irányítja. A Toák elkötnek egy szállító-hajót és így megmenekülnek az őket üldöző vahkik elől.

Közben a Colosseumban, Dume Turaga összehívja az összes matoránt, és bezáratja őket a matorán-tartályokba. A Toák az utolsó pillanatban érkeznek. Dume ekkor felfedi magát. Kiderül, hogy ő Makuta.

Míg a gonosz nekilát, hogy hatalmát kiterjessze az egész szigetre és megnövelje erejét, a Toák felpakolnak annyi matorán-tartályt, amennyit csak tudnak és a szállítóhajóval menekülnek. Út közben a Sötét Vadászok újabb támadással próbálkoznak. Ám Onewának elég használnia a maszkját és Krekka máris rátámad Nidhikire. A két Sötét Vadászt eztán már könnyen belelökik Makuta örvényébe, ami a Colosseum fölött kavarog.

Vakama összeilleszti a hat Korongot és megalkotja belőlük az Idő Maszkját, Vahi Kanohit. Egy látomásában meglátja, hogy a nagy Protodermisz Korláton túlra kell menekíteniük a matoránokat, ahol biztonságban lehetnek Makutától.

Ám mikor már elérnék a Korlátot, Makuta összegyűjti erejét és megteremti új alakját. A szárnyas szörnyeteggel Vakama száll harcba. Makuta az Idő Maszkját akarja. Vakama használja ellene, de Makuta keze még így is elérné, ha az odaugró Lhikan Turaga nem áldozná fel magát a Toáért. Lhikan meghal, de Vakama emlékeztetőül elteszi a nemes Turaga maszkját.

Vakama is felfedezi maszkja láthatatlanná tévő erejét és így ered Makuta után. Makuta már épp fetenné az Időmaszkot, mikor Vakama az utolsó pillanatban kilöki a kezéből egy Kanoka Koronggal. A maszk elsüllyed a protodermisz-tengerben. Makuta harcba száll Vakamával, de a Toa egy ügyes trükkel csapdába ejti. A hat Toa egyesíti erejét, minek következtében Makutát kristályos protodermisz borítja be. A gonosz a kristály fogságába kerül.

A Toák visszatérnek feladatukhoz és elviszik a matoránokat a Korláton túlra, egy szigetre, amit fény övez. Ám most, hogy Makutát legyőzték, nem hagyhatják ott a többi matoránt... ezzel kezdődik a következő kalandjuk.