Műfaja:Dráma, shi-fi, horror, ecchi
Epizódok: 13

Lucy márévek óta fogságban él egy elzárt sotét kamrában láncra verve. De miért élne így egy átlago lány? Láncra verve és a kormány által fogva tartva? Lucy nem egy átlagos lány, épp ellenkezőleg. Első ránézésre a fején lévő szarvak meglehetősen furcsának tűnnek. A többi teljesen normális. Ezek a kis szarvak figyelmeztetik az embert, hogy ő mégsem az, aminek látszik. Ő egy diclosnius. A dicloniusok hatlamas regenerális és telekinetikus képességgel rendelkeznek. Szarvaikban ugynevezett vektorok vannak, amiket nem mások, mint láthatatlan kezek. Ezekkel teszi ártalmatlanná "áldozatait". A kormány látszólag az emberiség megmentése érdekében zárta el ezeket a veszélyes "szörnyetegeket", ám a valódi céljuk korántsem ilyen nemes. Lucynek sikerül ebből az élő ketrecből megszöknie, ám az utolsó pillanatban jövés éri a fejét és ez tudathasadást okoz nála.
Kouta hosszú idő után visszatér a tengerparti városkába Yukához. A városban fogja folytatni a tanulmányait. A fiőú nem sok mindenre emlékszik a múltjából. Régen egy hatalmas trauma érte, amit nehezen sikerült feldolgoznia, és ez emlékezetkiesést időz elő nála. Kouta és Yuka épp a tengerparton sétálnak, amikor egy mezítelen lányt találnak a tengerből kijönni. A lány nem tud beszélni,cska annyit tud mondani "Nyuu". Kouta jó szívére hallgatva befogadja a lányt, s elnevezi Nyuu-nak. A jelek szerint a lány nem fogékony a szavak tanulására.
A kormány nem hagyja annyiban a szökött dicloniust. Egy csapat katonát küld felkeresésére.

Az Elfen Lied-nek van manga változata is. A jellemábrázolás eltér az animejétől. Az anime és a manga menete az elején egyezik, majd az anime a 8. epizódtól teljesen más irányba folytatódik. felfedezhetőek benne humoros részek, de leginkább véres és rendkívül megrázó jeleneteket tartalmaz.