A 21. század elején a egy úgynevezett B sejtek jelentek meg az emberi lakosság körében.A tudósok nem tudták megállítani ezeket a sejtmutációkat,azokat az embereket akikben megjelent a B sejt betették az alvóprogramba.Hogy segítsék az ellenszer kifejlesztését állatkisérleteket vettettek be,a tesztalanyok elszabadultak,keverettek normális társaikkal és hatalmasra nőttek.Igy 2017 ben megjelent a Blue, hamar elszaporodtak,kiirtották az emberiség nagy részét,akik életben maradtak azok ellenálási csoportokat hoztak létre és űrbe menekültek. A főhősünk Yuji Kaido aki egy alvó.A történet elején egy hibernáló központban találjuk magunkat ahol éppen főhősünket két katona és egy mecha kiséri aki egy kapszulában alszik,addig amíg meg nem jelenik egy szörnyeteg,Yuji fölébred és nem érti hogy mi történt.A blue megöli a két katonát de a hatalmas robottal már nem bír,Yuji eközben elmenekül és egy teremben szembetalálja magát a valósággal.Eközben megjelenik pár blue és rátámadnak.Főhősünket a mecha menti meg,a mechát irányító személy a másik főszereplő Marlene Angel aki egy katona a második földről.kijutnak a központból és Yuji megtudja hogy egy egész csapatot küldtek a kimentésére. Céljuk eljuttatni a "csomagot" a második földre.